פטנטים על אפליקציה ותוכנה וזכויות אחרות בקניין רוחני חשובים לממציאים ובעלי זכויות בקניין רוחני, רישום פטנטים על אפליקציה ותוכנה אפשריים במקרים מסוימים ביחד במידת האפשר, עם הגנה על זכויות קניין רוחני אחרות שגם עליהם כדאי להגן במידת האפשר.
פטנטים על אפליקציות ותוכנה הנו תחום חדש יחסית בעולם הפטנטים המסורתי לעומת פטנטים על מכאניקה, אלקטרוניקה, וחומים טכנולוגיים אחרים, תחום רישום הפטנט על אפליקציה ותוכנה סבוך יותר, לא בכל מקרה שיש אפליקציה או תוכנה חדשה אפשרי לקבל פטנט רשום.
בתחום פטנטים על אפליקציה ותוכנה ישנם מדיניות וחוקיים פנימיים שונים בין המדינות השונות, ודרכי הרישום והעילות בהן ניתן לקבל פטנט.
בישראל ניתן לקבל פטנט על תוכנה ואפליקציה במקרים מסוימים, בין שאר הדרישות, קיימת דרישה שההמצאה תהא בעלת אופי טכנולוגי מוחשי, לעומת ישראל, בארה"ב קל יותר להתגבר על דרישה זו, ולכן קל יותר לצלוח דרישה זו ולקבל פטנט על תוכנה ואפליקציה מאחר ואין דרישה שההמצאה תהא בתחום טכנולוגי.